Muutused soole mikrobioomis võivad ennustada kolorektaalvähki

Soole mikrobioomi muutused on teadaolevalt seotud kolorektaalvähiga. Hiirmudelis on vähiga seotud eeskätt Bacteroides fragilis ja Alistipes finegoldii. Käesolevas uuringus vaadati soole mikrobioomi kasutamise võimalusi jämesoole vähieelsete seisundite leidmisel.

Praegu mitmel pool kasutatav mitteinvasiivne peitveretest, mida patsiendid invasiivsetele uuringutele eelistaksid, annab palju valepositiivseid tulemusi ja toob tagajärjena kaasa mitmeid mittevajalikke kolonoskoopiaid. Mikrobioomi analüüs kombinatsioonis peitveretestiga võiks aidata üles leida rohkem tõelisi positiivseid juhtusid ja vähendada valepositiivseid tulemusi umbes poole võrra.

Hollandi teadlased uurisid aastate 2000-2022 andmete põhjal, kas kolorektaalvähk muudab soole mikrobioomi ja kas mikrobioomi muutused on seotud vähieelsete seisundite kujunemisega. Kasutati kolorektaalvähi sõeluuringu programmi, milleks Hollandis on sarnaselt Eestiga peitveretest.

Peitveretesti ja kolonoskoopiate andmeid lingiti Hollandi mikrobioomi teadusuuringu andmetega, kus vahemikus 2012-2015 koguti roojaproovid üle 8200 inimeselt. Sedasi oli võimalik omavahel kokku viia muutusi soole mikrobioomis ja põhjalikke andmeid histoloogiliste muutuste kohta vähieelsetes kolletes.

Võrreldi soole mikrobioota koostist, funktsiooni ja genoomset profiili nendel osalejatel, kelle vähieelsed muutused olid tekkinud juba enne roojaproovide kogumist vahemikus 2000-2015 ja nendel osalejatel, kelle vähieelsed muutused tekkisid pärast roojaproovide kogumist vahemikus 2015-2022. Kontrollgrupiks oli 2123 inimest, kelle kolonoskoopia leid oli normaalne.

Pärast roojaproovide kogumist leiti rohkem vähieelseid muutusi. Kui enne 2015. aastat oli vähieelseid muutusi leitud 219 osalejal (sealhulgas kerge düsplaasia, raske düsplaasia, serraatpolüübid ja 26 kolorektaalvähi juhtu), siis pärast 2015. aastat diagnoositi vähieelseid muutusi 315 osalejal ja leiti 29 kolorektaalvähki.

Kui vaadati mikrobioomi liigirikkust nendel inimestel, kellel prekantseroosid olid tekkinud 1-5 aastat enne roojaproovide kogumist, oli näha mikroobide liigiline vaesumine võrreldes kontrollidega. Kui aga vaadati nende inimeste mikrobioomi, kellel prekantseroosid kujunesid alles pärast roojaproovide kogumist, oli ka seal juba näha mikrobioomi vaesumist. Juba olemasolevate muutustega ja tulevikus kujunevate muutustega inimeste soole mikrobioomid olid omavahel erinevad. Samuti olid omavahel erinevad erinevat tüüpi muutustega inimeste soolemikroobid (kerged või rasked düsplastilised muutused, serraatpolüübid või kolorektaalvähk).

Nii olemasolevate kui tulevikus tekkivate muutustega inimeste sooles vähenes osade kommensaalide arvukus, näiteks Faecalibacterium. Kolorektaalvähiga inimestel oli jälgitav massiivne Alistipes finegoldii populatsiooni suurenemine. Tulevikus prekantserooside kujunemisega olid seotud Lachnospiraceae sugukonnast ning Roseburia ja Eubacterium perekonnast pärit bakterid. Mikrobioomi muutuste ennustav väärtus prekantserooside ja kolorektaalvähi tekke osas oli mõõdukas.

Seega on muutused soole mikrobioomis seotud nii kolorektaalvähi kui vähieelsete seisundite kujunemisega, kusjuures muutused mikrobioomis on jälgitavad juba enne prekantserooside teket. Uuringu tugevuseks on suur uuritavate arv ja võrdlemisi pikk jälgimisperiood.

Gut Microbiome Variations May Be Predictive of Precancerous Colonic Lesions, CRC - Medscape - Oct 18, 2023.