e-konsultatsioon, e-saatekiri, arst, arvuti, stetoskoop

Geenivaramu liitumine otsingumootoriga muudab teadlaste töö lihtsamaks

Eesti geenivaramul on kavas liituda Euroopa biopankasid ühendava BBMRI-ERIC ühendatud otsingumootoriga.

Avaldatud Viimati uuendatud

See võimaldab BBMRI-ERIC liikmesriikide teadlastel teha päringuid selle kohta, kas liikmeks oleval biopangal on kindlatele tunnustele vastavaid andmeid. Päringu vastuseks väljastatakse üldistatud statistiline teave selle kohta, kas ja mis mahus on Eesti geenivaramul otsitud tunnustele vastavaid andmeid. Statistiline teave ehk koondstatistika on numbriline väärtus mingi konkreetse tunnuse esinemise kohta kogu andmestikus üldiselt, mitte indiviidi tasemel.

Seni on kirjeldatud päringud toimunud nii, et teadlane saadab e-kirja teel päringu Eesti geenivaramu vastutavale töötlejale ning seejärel analüüsitakse geenivaramu andmestikku, et selgitada välja, kas seal on päringule vastavaid andmeid. BBMRI-ERIC ühendatud otsingumootoriga liitumine võimaldab päringule saata vastuse automatiseeritult, ilma, et geenivaramu peaks statistilist analüüsi läbi viima.

Kasutatav tarkvara komponent, mis lubab EGV-st saata vastuse BBMRI-ERIC kesksele platvormile, on täielikult geenivaramu vastutava töötleja kontrolli all ning pseudonüümitud koeproovi ja isikuandmeid ei väljastata.

Kui BBMRI-ERIC liikmesriigi teadlane uurib teatud haigust ja selle seost geenidega, võimaldab otsingumootor teadlasel senisest kiiremini ja tõhusamalt saada teavet selle kohta, millistes biopankades on vastava haiguskandjaga isikute andmeid. Selline protseduur on nn eelpäring, mis võimaldab teadlastel planeerida teadustöid oluliselt kiiremini ja täpsemalt ning hoiab kokku paljude inimeste tööaega. Samas on tagatud andmete turvalisus vähemalt samal tasemel kui varasema andmepäringute korralduse puhul. Lisaks langeb ära vajadus vahetada teadlaste ja geenivaramu vahel e-kirju andmete eelpäringute kohta.

Powered by Labrador CMS